导演:GAINAX、タツノコプロ
主演:未知
2000年,一个科学探险队在南极洲针对被称作“第一使徒”亚当的“光之巨人”进行探险。在对其进行接触实验时,“光之巨人”自毁,从而发生了“第二次冲击”,进而导致世界大战。最后,人类人口减半,地轴偏转、气候改变。根据对“第二次冲击”的调查,联合国在日本箱根成立人工进化研究所(即 GEHIRN)从事EVA(指机器人)的发展研究,后GEHIRN利用在人工进化研究所下方发现的巨大空洞建造了总部。 另一方面,联合国下属秘密组织SEELE为了使人类进化,开始实行人类补完计划,就是将所有人的灵魂汇集在一起,通过中和每个人的AT力场,使每个人回归LCL之海。 2004年,EVA初号机进行启动试验时发生事故,碇真嗣的母亲碇唯消失,碇源渡开始执行“碇源渡版本的人类补完计划”。2010年,GEHIRN被改建成NERV。 2015年开始,根据SEELE人类补完计划剧本的安排,一种巨型人形生物“使徒”开始在日本登陆,并向NERV总部进攻,NERV组织EVA消灭使徒。在NERV与使徒作战的同时,碇源渡秘密地执行它自己的计划。随着时间推移,碇源渡的计划逐渐被SEELE发现,NERV与SEELE产生了矛盾并不断恶化。Director's Cut版本的第21~24集由剧场版《Death》篇剪辑而成,收录在20周年纪念版的蓝光中。